令和5年５月 27 日、新型コロナウイルス感染症に係る水際対策の終了に伴い、５月８日より「感染症ゲノムサーベイランス（仮称）」が開始されます。これは新たな感染症の流入を監視することを目的とします。また航空会社に対して、従来の措置である「出国前 72 時間以内に受けた検査の陰性証明書」又は「ワクチンの接種証明書（３回）」のいずれかの保持について、搭乗前の確認の徹底は引き続き実施されますが、４月５日以降、入国時の確認は簡素化されます。
中国（香港・マカオを除く）からの直行旅客便での入国者に対しては、臨時的な措置として現在実施している「サンプル検査」は継続され、４月５日以降、「出国前 72 時間以内に受けた検査の陰性証明書の提出」に替えて、従来の措置である「出国前 72 時間以内に受けた検査の陰性証明書」又は「ワクチンの接種証明書（３回）」のいずれかの提出を求められます。
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